Bevers in Vlaanderen zijn beschermde diersoorten, waardoor het verboden is om het dier zelf en hun leefgebied te verstoren. Bevers vangen en verplaatsen of zelf doden, gebeurt enkel in zeer uitzonderlijke gevallen waarvoor er eerst een afwijking gevraagd moet worden, en is vaak een allerlaatste optie. Het is in de meeste gevallen ook geen duurzame maatregel, aangezien een vrij territorium gewoon wordt ingenomen door een andere bever.
Om schade en overlast door de bever in woon- en landbouwgebied te vermijden heeft een soortenbeschermingsprogramma Via het soortenbeschermingsprogramma voor de bever, zijn er verschillende maatregelen voorzien om schade en overlast door de bever in woon- en landbouwgebied te voorkomen. Dit om ervoor te zorgen dat de mens en natuur samen kunnen leven met elkaar.